代可可脂和可可脂的原料不同、味道不同、价格不同、功效不同。代可可脂主要是以月桂酸类油脂经过分提氢化工艺而加工出的特种油脂产品，而可可脂主要是从可可豆中压榨而出的脂肪。可可脂是纯正的巧克力，而代可可脂是人造的，所以价格要比代可可脂贵。可可脂含有丰富的多酚，具有很强的抗氧化功能，可以保护人体对抗一系列疾病；而代可可脂可能有反式脂肪酸，可能会对身体产生不良影响。
1、原料不同
大多数代可可脂的制作，是将植物油(棕榈油、豆油等)经过氢化油技术的处理，在金属催化剂的作用下，把氢加到甘油三酸酯的不饱和双键上，氢化后植物油就从也太变为固态或者半固态的油脂(塑型改变)，稳定性增加(抗氧化)，便于保存，且能延长保质期，大大降低成本。所以绝大多数代可可脂其实就是氢化棕榈仁油。
纯可可脂是由天然可可豆中提取出的一种乳黄色硬性天然植物油脂，有淡淡的可可豆清香。这种油脂比较特殊，随温度不同会呈现出液态、固态两种状态(以27℃为界限)，而这种特性一般只存在于动物油脂中。它几乎具备了各种植物油脂的一切优点，如今还未发现能与其相媲美的其它油脂。
2、味道不同
代可可脂做的巧克力吃到嘴里，最后会形成一种蜡质的感觉，在嘴巴里总是留那么一点不化掉。 纯可可脂做的巧克力吃到嘴里是入口即化，巧克力的回味会很浓郁。
3、作用不同
纯可可脂是不饱和脂肪酸，对健康有益，有抗氧化功能。研究资料显示纯可可脂巧克力中含有的多酚类物质，能有效地发挥抗氧化作用，调节血小板活动，改善心血管健康状况，可预防心血管疾病。
代可可脂中含有的反式脂肪酸，对人体健康有害。世卫组织估计，每年约有54万例死亡与摄入工业生产的反式脂肪酸有关。反式脂肪摄入量会使全因死亡风险增加34%，死于冠心病的风险增加28%，冠心病风险增加21%。
4、价格不同
可可脂是纯正的巧克力，而代可可脂是人造的，所以价格要比代可可脂贵。